Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HnrnpdQ60668 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HnrnpdQ60668 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HnrnpdQ60668 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HnrnpdQ60668 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HnrnpdQ60668 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HnrnpdQ60668 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HnrnpdQ60668 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HnrnpdQ60668 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HnrnpdQ60668 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HnrnpdQ60668 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HnrnpdQ60668 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HnrnpdQ60668 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HnrnpdQ60668 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HnrnpdQ60668 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HnrnpdQ60668 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HnrnpdQ60668 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HnrnpdQ60668 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HnrnpdQ60668 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HnrnpdQ60668 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HnrnpdQ60668 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HnrnpdQ60668 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HnrnpdQ60668 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HnrnpdQ60668 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HnrnpdQ60668 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HnrnpdQ60668 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HnrnpdQ60668 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HnrnpdQ60668 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HnrnpdQ60668 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HnrnpdQ60668 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HnrnpdQ60668 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HnrnpdQ60668 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms