Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.13■■■■■ 5.14
NacadQ5SWP3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
NacadQ5SWP3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.14
NacadQ5SWP3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.13
NacadQ5SWP3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC47.1■■■■■ 5.13
NacadQ5SWP3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
NacadQ5SWP3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
NacadQ5SWP3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.1■■■■■ 5.13
NacadQ5SWP3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
NacadQ5SWP3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
NacadQ5SWP3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
NacadQ5SWP3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
NacadQ5SWP3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
NacadQ5SWP3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
NacadQ5SWP3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC47.05■■■■■ 5.12
NacadQ5SWP3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
NacadQ5SWP3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47■■■■■ 5.12
NacadQ5SWP3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC47■■■■■ 5.12
NacadQ5SWP3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC47■■■■■ 5.12
NacadQ5SWP3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
NacadQ5SWP3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC46.99■■■■■ 5.11
NacadQ5SWP3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
NacadQ5SWP3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
NacadQ5SWP3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
NacadQ5SWP3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
NacadQ5SWP3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC46.96■■■■■ 5.11
NacadQ5SWP3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
NacadQ5SWP3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
NacadQ5SWP3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC46.95■■■■■ 5.11
NacadQ5SWP3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
NacadQ5SWP3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
NacadQ5SWP3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
NacadQ5SWP3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC46.93■■■■■ 5.1
NacadQ5SWP3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC46.93■■■■■ 5.1
NacadQ5SWP3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
NacadQ5SWP3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
NacadQ5SWP3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC46.86■■■■■ 5.09
NacadQ5SWP3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
NacadQ5SWP3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
NacadQ5SWP3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
NacadQ5SWP3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
NacadQ5SWP3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.83■■■■■ 5.09
NacadQ5SWP3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC46.83■■■■■ 5.09
NacadQ5SWP3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
NacadQ5SWP3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
NacadQ5SWP3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC46.82■■■■■ 5.09
NacadQ5SWP3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC46.81■■■■■ 5.08
NacadQ5SWP3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
NacadQ5SWP3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC46.78■■■■■ 5.08
NacadQ5SWP3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
NacadQ5SWP3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC46.75■■■■■ 5.07
NacadQ5SWP3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
NacadQ5SWP3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
NacadQ5SWP3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC46.69■■■■■ 5.07
NacadQ5SWP3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
NacadQ5SWP3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
NacadQ5SWP3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC46.69■■■■■ 5.06
NacadQ5SWP3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
NacadQ5SWP3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
NacadQ5SWP3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
NacadQ5SWP3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC46.66■■■■■ 5.06
NacadQ5SWP3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
NacadQ5SWP3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC46.64■■■■■ 5.06
NacadQ5SWP3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC46.64■■■■■ 5.06
NacadQ5SWP3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
NacadQ5SWP3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.05
NacadQ5SWP3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
NacadQ5SWP3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
NacadQ5SWP3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
NacadQ5SWP3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
NacadQ5SWP3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.6■■■■■ 5.05
NacadQ5SWP3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
NacadQ5SWP3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC46.58■■■■■ 5.05
NacadQ5SWP3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
NacadQ5SWP3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
NacadQ5SWP3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
NacadQ5SWP3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
NacadQ5SWP3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC46.52■■■■■ 5.04
NacadQ5SWP3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
NacadQ5SWP3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
NacadQ5SWP3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
NacadQ5SWP3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
NacadQ5SWP3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC46.5■■■■■ 5.03
NacadQ5SWP3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
NacadQ5SWP3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
NacadQ5SWP3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
NacadQ5SWP3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC46.44■■■■■ 5.03
NacadQ5SWP3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
NacadQ5SWP3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
NacadQ5SWP3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
NacadQ5SWP3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC46.42■■■■■ 5.02
NacadQ5SWP3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
NacadQ5SWP3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
NacadQ5SWP3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
NacadQ5SWP3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
NacadQ5SWP3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC46.39■■■■■ 5.02
NacadQ5SWP3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
NacadQ5SWP3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.34■■■■■ 5.01
NacadQ5SWP3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
NacadQ5SWP3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC46.34■■■■■ 5.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms