Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Mks1Q5SW45 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mks1Q5SW45 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mks1Q5SW45 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mks1Q5SW45 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mks1Q5SW45 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mks1Q5SW45 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mks1Q5SW45 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mks1Q5SW45 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mks1Q5SW45 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mks1Q5SW45 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mks1Q5SW45 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mks1Q5SW45 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mks1Q5SW45 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mks1Q5SW45 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mks1Q5SW45 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mks1Q5SW45 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms