Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bhlha9Q5RJB0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bhlha9Q5RJB0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bhlha9Q5RJB0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bhlha9Q5RJB0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bhlha9Q5RJB0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlha9Q5RJB0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bhlha9Q5RJB0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlha9Q5RJB0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms