Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RilpQ5ND29 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RilpQ5ND29 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RilpQ5ND29 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RilpQ5ND29 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RilpQ5ND29 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RilpQ5ND29 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RilpQ5ND29 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RilpQ5ND29 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RilpQ5ND29 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RilpQ5ND29 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RilpQ5ND29 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RilpQ5ND29 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RilpQ5ND29 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RilpQ5ND29 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RilpQ5ND29 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RilpQ5ND29 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RilpQ5ND29 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RilpQ5ND29 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RilpQ5ND29 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms