Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rapgef6Q5NCJ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rapgef6Q5NCJ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rapgef6Q5NCJ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rapgef6Q5NCJ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Rapgef6Q5NCJ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rapgef6Q5NCJ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rapgef6Q5NCJ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rapgef6Q5NCJ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Rapgef6Q5NCJ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Rapgef6Q5NCJ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rapgef6Q5NCJ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rapgef6Q5NCJ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rapgef6Q5NCJ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rapgef6Q5NCJ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rapgef6Q5NCJ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rapgef6Q5NCJ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rapgef6Q5NCJ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rapgef6Q5NCJ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rapgef6Q5NCJ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rapgef6Q5NCJ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rapgef6Q5NCJ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rapgef6Q5NCJ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rapgef6Q5NCJ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rapgef6Q5NCJ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rapgef6Q5NCJ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Rapgef6Q5NCJ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Rapgef6Q5NCJ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rapgef6Q5NCJ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rapgef6Q5NCJ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rapgef6Q5NCJ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rapgef6Q5NCJ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Rapgef6Q5NCJ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Rapgef6Q5NCJ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Rapgef6Q5NCJ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Rapgef6Q5NCJ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rapgef6Q5NCJ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rapgef6Q5NCJ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rapgef6Q5NCJ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Rapgef6Q5NCJ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rapgef6Q5NCJ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rapgef6Q5NCJ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rapgef6Q5NCJ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rapgef6Q5NCJ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rapgef6Q5NCJ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rapgef6Q5NCJ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rapgef6Q5NCJ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rapgef6Q5NCJ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rapgef6Q5NCJ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rapgef6Q5NCJ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rapgef6Q5NCJ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rapgef6Q5NCJ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rapgef6Q5NCJ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rapgef6Q5NCJ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rapgef6Q5NCJ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rapgef6Q5NCJ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rapgef6Q5NCJ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rapgef6Q5NCJ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rapgef6Q5NCJ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Rapgef6Q5NCJ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Rapgef6Q5NCJ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rapgef6Q5NCJ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rapgef6Q5NCJ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Rapgef6Q5NCJ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Rapgef6Q5NCJ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Rapgef6Q5NCJ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rapgef6Q5NCJ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rapgef6Q5NCJ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rapgef6Q5NCJ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rapgef6Q5NCJ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rapgef6Q5NCJ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Rapgef6Q5NCJ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rapgef6Q5NCJ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Rapgef6Q5NCJ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms