Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eri2Q5BKS4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eri2Q5BKS4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Eri2Q5BKS4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eri2Q5BKS4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eri2Q5BKS4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Eri2Q5BKS4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Eri2Q5BKS4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Eri2Q5BKS4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eri2Q5BKS4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eri2Q5BKS4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Eri2Q5BKS4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eri2Q5BKS4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eri2Q5BKS4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eri2Q5BKS4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eri2Q5BKS4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eri2Q5BKS4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eri2Q5BKS4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eri2Q5BKS4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eri2Q5BKS4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eri2Q5BKS4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eri2Q5BKS4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Eri2Q5BKS4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Eri2Q5BKS4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eri2Q5BKS4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eri2Q5BKS4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eri2Q5BKS4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eri2Q5BKS4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eri2Q5BKS4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eri2Q5BKS4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eri2Q5BKS4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eri2Q5BKS4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eri2Q5BKS4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eri2Q5BKS4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eri2Q5BKS4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eri2Q5BKS4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eri2Q5BKS4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eri2Q5BKS4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eri2Q5BKS4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eri2Q5BKS4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eri2Q5BKS4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eri2Q5BKS4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eri2Q5BKS4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eri2Q5BKS4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eri2Q5BKS4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eri2Q5BKS4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eri2Q5BKS4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eri2Q5BKS4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eri2Q5BKS4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eri2Q5BKS4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Eri2Q5BKS4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eri2Q5BKS4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eri2Q5BKS4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eri2Q5BKS4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Eri2Q5BKS4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eri2Q5BKS4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eri2Q5BKS4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eri2Q5BKS4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eri2Q5BKS4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eri2Q5BKS4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eri2Q5BKS4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eri2Q5BKS4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eri2Q5BKS4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eri2Q5BKS4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eri2Q5BKS4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eri2Q5BKS4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eri2Q5BKS4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eri2Q5BKS4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Eri2Q5BKS4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eri2Q5BKS4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eri2Q5BKS4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Eri2Q5BKS4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eri2Q5BKS4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eri2Q5BKS4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eri2Q5BKS4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eri2Q5BKS4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eri2Q5BKS4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eri2Q5BKS4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms