Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKR2

Slc9b2, Sodium/hydrogen exchanger 9B2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9b2Q5BKR2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9b2Q5BKR2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9b2Q5BKR2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9b2Q5BKR2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9b2Q5BKR2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9b2Q5BKR2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9b2Q5BKR2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9b2Q5BKR2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9b2Q5BKR2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9b2Q5BKR2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9b2Q5BKR2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9b2Q5BKR2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9b2Q5BKR2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9b2Q5BKR2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9b2Q5BKR2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc9b2Q5BKR2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9b2Q5BKR2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9b2Q5BKR2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc9b2Q5BKR2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc9b2Q5BKR2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc9b2Q5BKR2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc9b2Q5BKR2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc9b2Q5BKR2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc9b2Q5BKR2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc9b2Q5BKR2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc9b2Q5BKR2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc9b2Q5BKR2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc9b2Q5BKR2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc9b2Q5BKR2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc9b2Q5BKR2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc9b2Q5BKR2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc9b2Q5BKR2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc9b2Q5BKR2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc9b2Q5BKR2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc9b2Q5BKR2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9b2Q5BKR2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9b2Q5BKR2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9b2Q5BKR2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc9b2Q5BKR2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc9b2Q5BKR2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc9b2Q5BKR2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc9b2Q5BKR2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc9b2Q5BKR2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9b2Q5BKR2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9b2Q5BKR2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9b2Q5BKR2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms