Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm14685Q52KH6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm14685Q52KH6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm14685Q52KH6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm14685Q52KH6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm14685Q52KH6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm14685Q52KH6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm14685Q52KH6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm14685Q52KH6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm14685Q52KH6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm14685Q52KH6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm14685Q52KH6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm14685Q52KH6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm14685Q52KH6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm14685Q52KH6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm14685Q52KH6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm14685Q52KH6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm14685Q52KH6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm14685Q52KH6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm14685Q52KH6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm14685Q52KH6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm14685Q52KH6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm14685Q52KH6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm14685Q52KH6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm14685Q52KH6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm14685Q52KH6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm14685Q52KH6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm14685Q52KH6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm14685Q52KH6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm14685Q52KH6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm14685Q52KH6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm14685Q52KH6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms