Protein–RNA interactions for Protein: Q4VK74

Ifnl2, Interferon lambda-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl2Q4VK74 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnl2Q4VK74 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnl2Q4VK74 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifnl2Q4VK74 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifnl2Q4VK74 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifnl2Q4VK74 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifnl2Q4VK74 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnl2Q4VK74 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnl2Q4VK74 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifnl2Q4VK74 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifnl2Q4VK74 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifnl2Q4VK74 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifnl2Q4VK74 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifnl2Q4VK74 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifnl2Q4VK74 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnl2Q4VK74 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnl2Q4VK74 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifnl2Q4VK74 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifnl2Q4VK74 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifnl2Q4VK74 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifnl2Q4VK74 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifnl2Q4VK74 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifnl2Q4VK74 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifnl2Q4VK74 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifnl2Q4VK74 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifnl2Q4VK74 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifnl2Q4VK74 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifnl2Q4VK74 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifnl2Q4VK74 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifnl2Q4VK74 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifnl2Q4VK74 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifnl2Q4VK74 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifnl2Q4VK74 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifnl2Q4VK74 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms