Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa20Q45VN2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa20Q45VN2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa20Q45VN2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa20Q45VN2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms