Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZA1

Rcsd1, CapZ-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcsd1Q3UZA1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rcsd1Q3UZA1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rcsd1Q3UZA1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rcsd1Q3UZA1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rcsd1Q3UZA1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rcsd1Q3UZA1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rcsd1Q3UZA1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rcsd1Q3UZA1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rcsd1Q3UZA1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rcsd1Q3UZA1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rcsd1Q3UZA1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rcsd1Q3UZA1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rcsd1Q3UZA1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rcsd1Q3UZA1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rcsd1Q3UZA1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rcsd1Q3UZA1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rcsd1Q3UZA1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rcsd1Q3UZA1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rcsd1Q3UZA1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rcsd1Q3UZA1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rcsd1Q3UZA1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rcsd1Q3UZA1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rcsd1Q3UZA1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rcsd1Q3UZA1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rcsd1Q3UZA1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rcsd1Q3UZA1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rcsd1Q3UZA1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rcsd1Q3UZA1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rcsd1Q3UZA1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rcsd1Q3UZA1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rcsd1Q3UZA1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rcsd1Q3UZA1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rcsd1Q3UZA1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rcsd1Q3UZA1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rcsd1Q3UZA1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms