Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
E330034G19RikQ3UWX6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E330034G19RikQ3UWX6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E330034G19RikQ3UWX6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E330034G19RikQ3UWX6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E330034G19RikQ3UWX6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E330034G19RikQ3UWX6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E330034G19RikQ3UWX6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
E330034G19RikQ3UWX6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E330034G19RikQ3UWX6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E330034G19RikQ3UWX6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
E330034G19RikQ3UWX6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E330034G19RikQ3UWX6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E330034G19RikQ3UWX6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E330034G19RikQ3UWX6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E330034G19RikQ3UWX6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E330034G19RikQ3UWX6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E330034G19RikQ3UWX6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E330034G19RikQ3UWX6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E330034G19RikQ3UWX6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E330034G19RikQ3UWX6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E330034G19RikQ3UWX6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E330034G19RikQ3UWX6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E330034G19RikQ3UWX6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms