Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctsll3Q3ULP7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctsll3Q3ULP7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctsll3Q3ULP7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctsll3Q3ULP7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctsll3Q3ULP7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctsll3Q3ULP7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctsll3Q3ULP7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctsll3Q3ULP7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctsll3Q3ULP7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctsll3Q3ULP7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctsll3Q3ULP7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctsll3Q3ULP7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctsll3Q3ULP7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctsll3Q3ULP7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctsll3Q3ULP7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctsll3Q3ULP7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctsll3Q3ULP7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctsll3Q3ULP7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctsll3Q3ULP7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctsll3Q3ULP7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctsll3Q3ULP7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctsll3Q3ULP7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctsll3Q3ULP7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctsll3Q3ULP7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctsll3Q3ULP7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctsll3Q3ULP7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctsll3Q3ULP7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctsll3Q3ULP7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctsll3Q3ULP7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctsll3Q3ULP7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctsll3Q3ULP7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctsll3Q3ULP7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctsll3Q3ULP7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctsll3Q3ULP7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctsll3Q3ULP7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctsll3Q3ULP7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctsll3Q3ULP7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctsll3Q3ULP7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctsll3Q3ULP7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctsll3Q3ULP7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctsll3Q3ULP7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctsll3Q3ULP7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms