Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtpbp2Q3UJK4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp2Q3UJK4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp2Q3UJK4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp2Q3UJK4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp2Q3UJK4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp2Q3UJK4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp2Q3UJK4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtpbp2Q3UJK4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtpbp2Q3UJK4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtpbp2Q3UJK4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtpbp2Q3UJK4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtpbp2Q3UJK4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtpbp2Q3UJK4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtpbp2Q3UJK4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtpbp2Q3UJK4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtpbp2Q3UJK4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtpbp2Q3UJK4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtpbp2Q3UJK4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtpbp2Q3UJK4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtpbp2Q3UJK4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtpbp2Q3UJK4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtpbp2Q3UJK4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtpbp2Q3UJK4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtpbp2Q3UJK4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtpbp2Q3UJK4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtpbp2Q3UJK4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtpbp2Q3UJK4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtpbp2Q3UJK4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtpbp2Q3UJK4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtpbp2Q3UJK4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtpbp2Q3UJK4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtpbp2Q3UJK4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtpbp2Q3UJK4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtpbp2Q3UJK4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtpbp2Q3UJK4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtpbp2Q3UJK4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp2Q3UJK4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp2Q3UJK4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms