Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpr55Q3UJF0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpr55Q3UJF0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpr55Q3UJF0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpr55Q3UJF0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpr55Q3UJF0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpr55Q3UJF0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpr55Q3UJF0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpr55Q3UJF0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpr55Q3UJF0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpr55Q3UJF0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpr55Q3UJF0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpr55Q3UJF0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpr55Q3UJF0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpr55Q3UJF0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpr55Q3UJF0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpr55Q3UJF0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpr55Q3UJF0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpr55Q3UJF0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.7 ms