Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dtx3lQ3UIR3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dtx3lQ3UIR3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dtx3lQ3UIR3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dtx3lQ3UIR3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dtx3lQ3UIR3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dtx3lQ3UIR3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dtx3lQ3UIR3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Dtx3lQ3UIR3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dtx3lQ3UIR3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dtx3lQ3UIR3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dtx3lQ3UIR3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dtx3lQ3UIR3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dtx3lQ3UIR3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dtx3lQ3UIR3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dtx3lQ3UIR3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dtx3lQ3UIR3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dtx3lQ3UIR3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dtx3lQ3UIR3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dtx3lQ3UIR3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dtx3lQ3UIR3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Dtx3lQ3UIR3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dtx3lQ3UIR3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dtx3lQ3UIR3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dtx3lQ3UIR3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Dtx3lQ3UIR3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dtx3lQ3UIR3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dtx3lQ3UIR3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dtx3lQ3UIR3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dtx3lQ3UIR3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dtx3lQ3UIR3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dtx3lQ3UIR3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Dtx3lQ3UIR3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dtx3lQ3UIR3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dtx3lQ3UIR3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dtx3lQ3UIR3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dtx3lQ3UIR3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Dtx3lQ3UIR3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dtx3lQ3UIR3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dtx3lQ3UIR3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dtx3lQ3UIR3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dtx3lQ3UIR3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dtx3lQ3UIR3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dtx3lQ3UIR3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dtx3lQ3UIR3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms