Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rapgef1Q3UHC1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rapgef1Q3UHC1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rapgef1Q3UHC1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rapgef1Q3UHC1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rapgef1Q3UHC1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rapgef1Q3UHC1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rapgef1Q3UHC1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rapgef1Q3UHC1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rapgef1Q3UHC1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rapgef1Q3UHC1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rapgef1Q3UHC1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rapgef1Q3UHC1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rapgef1Q3UHC1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rapgef1Q3UHC1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rapgef1Q3UHC1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgef1Q3UHC1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rapgef1Q3UHC1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rapgef1Q3UHC1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rapgef1Q3UHC1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rapgef1Q3UHC1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rapgef1Q3UHC1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef1Q3UHC1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef1Q3UHC1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef1Q3UHC1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef1Q3UHC1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgef1Q3UHC1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgef1Q3UHC1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgef1Q3UHC1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef1Q3UHC1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef1Q3UHC1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef1Q3UHC1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef1Q3UHC1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef1Q3UHC1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rapgef1Q3UHC1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rapgef1Q3UHC1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rapgef1Q3UHC1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rapgef1Q3UHC1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rapgef1Q3UHC1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rapgef1Q3UHC1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rapgef1Q3UHC1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rapgef1Q3UHC1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rapgef1Q3UHC1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rapgef1Q3UHC1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rapgef1Q3UHC1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rapgef1Q3UHC1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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