Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc177Q3UHB8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc177Q3UHB8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc177Q3UHB8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms