Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frmd8Q3UFK8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frmd8Q3UFK8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmd8Q3UFK8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmd8Q3UFK8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmd8Q3UFK8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmd8Q3UFK8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms