Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmd8Q3UFK8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frmd8Q3UFK8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Frmd8Q3UFK8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmd8Q3UFK8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmd8Q3UFK8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmd8Q3UFK8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frmd8Q3UFK8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frmd8Q3UFK8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmd8Q3UFK8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmd8Q3UFK8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmd8Q3UFK8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frmd8Q3UFK8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms