Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
InipQ3TXT3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
InipQ3TXT3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
InipQ3TXT3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
InipQ3TXT3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
InipQ3TXT3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
InipQ3TXT3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
InipQ3TXT3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
InipQ3TXT3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
InipQ3TXT3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
InipQ3TXT3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
InipQ3TXT3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
InipQ3TXT3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
InipQ3TXT3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
InipQ3TXT3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
InipQ3TXT3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
InipQ3TXT3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
InipQ3TXT3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
InipQ3TXT3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms