Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms