Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc102aQ3TMW1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc102aQ3TMW1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc102aQ3TMW1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc102aQ3TMW1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms