Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hddc2Q3SXD3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hddc2Q3SXD3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hddc2Q3SXD3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hddc2Q3SXD3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hddc2Q3SXD3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hddc2Q3SXD3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hddc2Q3SXD3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms