Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hddc2Q3SXD3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hddc2Q3SXD3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hddc2Q3SXD3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hddc2Q3SXD3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hddc2Q3SXD3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hddc2Q3SXD3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hddc2Q3SXD3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hddc2Q3SXD3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hddc2Q3SXD3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hddc2Q3SXD3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms