Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 SPE2YOL052C 1191 nt7.98□□□□□ -1.13
SNF8Q12483 PGC1YPL206C 966 nt7.98□□□□□ -1.13
SNF8Q12483 PAU5YFL020C 369 nt7.97□□□□□ -1.13
SNF8Q12483 MTO1YGL236C 2010 nt7.95□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 GAS1YMR307W 1680 nt7.95□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 STP3YLR375W 1032 nt7.94□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 KRE1YNL322C 942 nt7.93□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 PTC6YCR079W 1329 nt7.93□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 IGD1YFR017C 588 nt7.92□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 YPT11YNL304W 1254 nt7.92□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 AAC3YBR085W 924 nt7.92□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 YMC2YBR104W 990 nt7.92□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 AAT1YKL106W 1356 nt7.92□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 TRP2YER090W 1524 nt7.92□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 HXT11YOL156W 1704 nt7.92□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 PAR32YDL173W 888 nt7.91□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 PHB2YGR231C 933 nt7.91□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 YBR232CYBR232C 360 nt7.91□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 SDS24YBR214W 1584 nt7.91□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 THI6YPL214C 1623 nt7.91□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 YLR072WYLR072W 2082 nt7.91□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 ESS1YJR017C 513 nt7.9□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 YKR012CYKR012C 378 nt7.9□□□□□ -1.14
SNF8Q12483 MCM5YLR274W 2328 nt7.89□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 VBA3YCL069W 1377 nt7.89□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 ADH3YMR083W 1128 nt7.89□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 MRS4YKR052C 915 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 FRA1YLL029W 2250 nt7.88□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 TMS1YDR105C 1422 nt7.86□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 ALD5YER073W 1563 nt7.86□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.86□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 TPN1YGL186C 1740 nt7.86□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 EMC3YKL207W 762 nt7.85□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 HXK1YFR053C 1458 nt7.84□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 SRM1YGL097W 1449 nt7.84□□□□□ -1.15
SNF8Q12483 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.83□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.83□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.83□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 HBS1YKR084C 1836 nt7.83□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 LYS20YDL182W 1287 nt7.83□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 snR86snR86 1004 nt7.83□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 YOR072WYOR072W 315 nt7.83□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.82□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 NSG2YNL156C 900 nt7.82□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 MIM1YOL026C 342 nt7.82□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 MAS1YLR163C 1389 nt7.82□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.81□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.81□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.81□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.81□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.81□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.81□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.81□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.81□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.81□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.81□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.81□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 YFR020WYFR020W 699 nt7.81□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 FLX1YIL134W 936 nt7.81□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 ENO1YGR254W 1314 nt7.79□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 YBR056WYBR056W 1506 nt7.79□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 MOB1YIL106W 945 nt7.79□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 RSM7YJR113C 744 nt7.79□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 YMR210WYMR210W 1350 nt7.79□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 DUR3YHL016C 2208 nt7.78□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 IPL1YPL209C 1104 nt7.78□□□□□ -1.16
SNF8Q12483 YIR035CYIR035C 765 nt7.76□□□□□ -1.17
SNF8Q12483 LEA1YPL213W 717 nt7.76□□□□□ -1.17
SNF8Q12483 ABP1YCR088W 1779 nt7.76□□□□□ -1.17
SNF8Q12483 YIL177CYIL177C 5277 nt7.76□□□□□ -1.17
SNF8Q12483 ORT1YOR130C 879 nt7.75□□□□□ -1.17
SNF8Q12483 MEX67YPL169C 1800 nt7.75□□□□□ -1.17
SNF8Q12483 FTH1YBR207W 1398 nt7.74□□□□□ -1.17
SNF8Q12483 YJL009WYJL009W 327 nt7.74□□□□□ -1.17
SNF8Q12483 TOM71YHR117W 1920 nt7.74□□□□□ -1.17
SNF8Q12483 YJR149WYJR149W 1215 nt7.73□□□□□ -1.17
SNF8Q12483 SRP102YKL154W 735 nt7.73□□□□□ -1.17
SNF8Q12483 BUB2YMR055C 921 nt7.73□□□□□ -1.17
SNF8Q12483 CYC3YAL039C 810 nt7.72□□□□□ -1.17
SNF8Q12483 HIS3YOR202W 663 nt7.72□□□□□ -1.17
SNF8Q12483 MEP1YGR121C 1479 nt7.72□□□□□ -1.17
SNF8Q12483 YJL064WYJL064W 396 nt7.7□□□□□ -1.18
SNF8Q12483 SEN2YLR105C 1134 nt7.7□□□□□ -1.18
SNF8Q12483 YLR280CYLR280C 351 nt7.7□□□□□ -1.18
SNF8Q12483 RNA170RNA170 169 nt7.7□□□□□ -1.18
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