Protein–RNA interactions for Protein: Q12149

RRP6, Exosome complex exonuclease RRP6, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP6Q12149 ADH7YCR105W 1086 nt9.07□□□□□ -0.96
RRP6Q12149 NAS2YIL007C 663 nt9.07□□□□□ -0.96
RRP6Q12149 MTO1YGL236C 2010 nt9.06□□□□□ -0.96
RRP6Q12149 PAB1YER165W 1734 nt9.05□□□□□ -0.96
RRP6Q12149 REX2YLR059C 810 nt9.05□□□□□ -0.96
RRP6Q12149 CDD1YLR245C 429 nt9.05□□□□□ -0.96
RRP6Q12149 SPE2YOL052C 1191 nt9.04□□□□□ -0.96
RRP6Q12149 THP3YPR045C 1413 nt9.04□□□□□ -0.96
RRP6Q12149 PAU15YIR041W 375 nt9.03□□□□□ -0.96
RRP6Q12149 YMC2YBR104W 990 nt9.03□□□□□ -0.96
RRP6Q12149 TRP2YER090W 1524 nt9.03□□□□□ -0.96
RRP6Q12149 AAT1YKL106W 1356 nt9.02□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 GAS1YMR307W 1680 nt9.02□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 FSH2YMR222C 672 nt9.01□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 HXT11YOL156W 1704 nt9.01□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 THI6YPL214C 1623 nt9.01□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 ALD5YER073W 1563 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 KRE1YNL322C 942 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 PTC6YCR079W 1329 nt9□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 HXK1YFR053C 1458 nt8.99□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 TOK1YJL093C 2076 nt8.99□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 AAC3YBR085W 924 nt8.98□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 YLR072WYLR072W 2082 nt8.98□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 PAU5YFL020C 369 nt8.97□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 ESS1YJR017C 513 nt8.97□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 MRS4YKR052C 915 nt8.97□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 YOR072WYOR072W 315 nt8.97□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 GAL2YLR081W 1725 nt8.97□□□□□ -0.97
RRP6Q12149 EMC3YKL207W 762 nt8.96□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 YPT11YNL304W 1254 nt8.96□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 PGC1YPL206C 966 nt8.96□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 YKR012CYKR012C 378 nt8.95□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 SDS24YBR214W 1584 nt8.95□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 GNP1YDR508C 1992 nt8.94□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 TPN1YGL186C 1740 nt8.94□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 MIM1YOL026C 342 nt8.93□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 HBS1YKR084C 1836 nt8.93□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 SRM1YGL097W 1449 nt8.92□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 VBA3YCL069W 1377 nt8.92□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 IGD1YFR017C 588 nt8.92□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 PHB2YGR231C 933 nt8.92□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 STP3YLR375W 1032 nt8.92□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 TMS1YDR105C 1422 nt8.91□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 snR86snR86 1004 nt8.91□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 ADH3YMR083W 1128 nt8.91□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 PAR32YDL173W 888 nt8.9□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 NAS6YGR232W 687 nt8.9□□□□□ -0.98
RRP6Q12149 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.89□□□□□ -0.99
RRP6Q12149 MEX67YPL169C 1800 nt8.88□□□□□ -0.99
RRP6Q12149 DUR3YHL016C 2208 nt8.88□□□□□ -0.99
RRP6Q12149 YMR210WYMR210W 1350 nt8.87□□□□□ -0.99
RRP6Q12149 YBR232CYBR232C 360 nt8.86□□□□□ -0.99
RRP6Q12149 LYS20YDL182W 1287 nt8.85□□□□□ -0.99
RRP6Q12149 ORT1YOR130C 879 nt8.85□□□□□ -0.99
RRP6Q12149 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.85□□□□□ -0.99
RRP6Q12149 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.85□□□□□ -0.99
RRP6Q12149 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.85□□□□□ -0.99
RRP6Q12149 NAP1YKR048C 1254 nt8.84□□□□□ -0.99
RRP6Q12149 YFR020WYFR020W 699 nt8.83□□□□□ -1
RRP6Q12149 RSM7YJR113C 744 nt8.83□□□□□ -1
RRP6Q12149 LEA1YPL213W 717 nt8.83□□□□□ -1
RRP6Q12149 YBR056WYBR056W 1506 nt8.83□□□□□ -1
RRP6Q12149 ABP1YCR088W 1779 nt8.82□□□□□ -1
RRP6Q12149 MOB1YIL106W 945 nt8.82□□□□□ -1
RRP6Q12149 FTH1YBR207W 1398 nt8.82□□□□□ -1
RRP6Q12149 ENO1YGR254W 1314 nt8.81□□□□□ -1
RRP6Q12149 YJL009WYJL009W 327 nt8.81□□□□□ -1
RRP6Q12149 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.8□□□□□ -1
RRP6Q12149 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.8□□□□□ -1
RRP6Q12149 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.8□□□□□ -1
RRP6Q12149 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.8□□□□□ -1
RRP6Q12149 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.8□□□□□ -1
RRP6Q12149 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.8□□□□□ -1
RRP6Q12149 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.8□□□□□ -1
RRP6Q12149 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.8□□□□□ -1
RRP6Q12149 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.8□□□□□ -1
RRP6Q12149 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.8□□□□□ -1
RRP6Q12149 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.8□□□□□ -1
RRP6Q12149 FLX1YIL134W 936 nt8.8□□□□□ -1
RRP6Q12149 YIR035CYIR035C 765 nt8.79□□□□□ -1
RRP6Q12149 YIL177CYIL177C 5277 nt8.79□□□□□ -1
RRP6Q12149 MEP1YGR121C 1479 nt8.78□□□□□ -1
RRP6Q12149 YJR149WYJR149W 1215 nt8.78□□□□□ -1
RRP6Q12149 BUB2YMR055C 921 nt8.78□□□□□ -1
RRP6Q12149 HIS3YOR202W 663 nt8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.5 ms