Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd12Q0VE29 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Samd12Q0VE29 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd12Q0VE29 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd12Q0VE29 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd12Q0VE29 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms