Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Lrriq1Q0P5X1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC41■■■■■ 4.15
Lrriq1Q0P5X1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Lrriq1Q0P5X1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Lrriq1Q0P5X1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Lrriq1Q0P5X1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Lrriq1Q0P5X1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Lrriq1Q0P5X1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Lrriq1Q0P5X1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Lrriq1Q0P5X1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Lrriq1Q0P5X1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Lrriq1Q0P5X1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Lrriq1Q0P5X1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Lrriq1Q0P5X1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
Lrriq1Q0P5X1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Lrriq1Q0P5X1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Lrriq1Q0P5X1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC40.9■■■■■ 4.14
Lrriq1Q0P5X1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
Lrriq1Q0P5X1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Lrriq1Q0P5X1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Lrriq1Q0P5X1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
Lrriq1Q0P5X1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Lrriq1Q0P5X1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Lrriq1Q0P5X1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Lrriq1Q0P5X1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
Lrriq1Q0P5X1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Lrriq1Q0P5X1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Lrriq1Q0P5X1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Lrriq1Q0P5X1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Lrriq1Q0P5X1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Lrriq1Q0P5X1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Lrriq1Q0P5X1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
Lrriq1Q0P5X1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Lrriq1Q0P5X1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Lrriq1Q0P5X1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Lrriq1Q0P5X1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Lrriq1Q0P5X1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Lrriq1Q0P5X1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Lrriq1Q0P5X1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Lrriq1Q0P5X1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Lrriq1Q0P5X1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Lrriq1Q0P5X1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Lrriq1Q0P5X1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Lrriq1Q0P5X1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Lrriq1Q0P5X1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Lrriq1Q0P5X1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Lrriq1Q0P5X1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Lrriq1Q0P5X1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Lrriq1Q0P5X1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
Lrriq1Q0P5X1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Lrriq1Q0P5X1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Lrriq1Q0P5X1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Lrriq1Q0P5X1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
Lrriq1Q0P5X1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Lrriq1Q0P5X1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Lrriq1Q0P5X1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Lrriq1Q0P5X1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Lrriq1Q0P5X1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Lrriq1Q0P5X1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Lrriq1Q0P5X1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Lrriq1Q0P5X1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
Lrriq1Q0P5X1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
Lrriq1Q0P5X1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Lrriq1Q0P5X1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Lrriq1Q0P5X1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Lrriq1Q0P5X1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Lrriq1Q0P5X1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Lrriq1Q0P5X1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Lrriq1Q0P5X1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Lrriq1Q0P5X1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Lrriq1Q0P5X1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Lrriq1Q0P5X1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Lrriq1Q0P5X1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Lrriq1Q0P5X1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Lrriq1Q0P5X1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Lrriq1Q0P5X1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
Lrriq1Q0P5X1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Lrriq1Q0P5X1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Lrriq1Q0P5X1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Lrriq1Q0P5X1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Lrriq1Q0P5X1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
Lrriq1Q0P5X1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Lrriq1Q0P5X1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Lrriq1Q0P5X1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Lrriq1Q0P5X1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Lrriq1Q0P5X1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Lrriq1Q0P5X1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Lrriq1Q0P5X1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
Lrriq1Q0P5X1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Lrriq1Q0P5X1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Lrriq1Q0P5X1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Lrriq1Q0P5X1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Lrriq1Q0P5X1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Lrriq1Q0P5X1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Lrriq1Q0P5X1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms