Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf3Q07104 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdf3Q07104 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gdf3Q07104 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf3Q07104 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf3Q07104 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf3Q07104 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf3Q07104 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf3Q07104 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf3Q07104 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gdf3Q07104 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdf3Q07104 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf3Q07104 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf3Q07104 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf3Q07104 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf3Q07104 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdf3Q07104 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf3Q07104 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf3Q07104 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdf3Q07104 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms