Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sox9Q04887 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sox9Q04887 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox9Q04887 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox9Q04887 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox9Q04887 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox9Q04887 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox9Q04887 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox9Q04887 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox9Q04887 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox9Q04887 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox9Q04887 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox9Q04887 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox9Q04887 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox9Q04887 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox9Q04887 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox9Q04887 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox9Q04887 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox9Q04887 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox9Q04887 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox9Q04887 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox9Q04887 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox9Q04887 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox9Q04887 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox9Q04887 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox9Q04887 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox9Q04887 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox9Q04887 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox9Q04887 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox9Q04887 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox9Q04887 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox9Q04887 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox9Q04887 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox9Q04887 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox9Q04887 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox9Q04887 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox9Q04887 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox9Q04887 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox9Q04887 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox9Q04887 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox9Q04887 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox9Q04887 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox9Q04887 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox9Q04887 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox9Q04887 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox9Q04887 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox9Q04887 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox9Q04887 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox9Q04887 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox9Q04887 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox9Q04887 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox9Q04887 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox9Q04887 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox9Q04887 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms