Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emx1Q04742 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emx1Q04742 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emx1Q04742 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Emx1Q04742 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Emx1Q04742 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms