Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nf1Q04690 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nf1Q04690 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nf1Q04690 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nf1Q04690 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms