Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Kcnd1Q03719 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcnd1Q03719 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcnd1Q03719 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcnd1Q03719 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcnd1Q03719 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kcnd1Q03719 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kcnd1Q03719 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcnd1Q03719 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcnd1Q03719 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcnd1Q03719 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnd1Q03719 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnd1Q03719 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnd1Q03719 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kcnd1Q03719 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kcnd1Q03719 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcnd1Q03719 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcnd1Q03719 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcnd1Q03719 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kcnd1Q03719 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnd1Q03719 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnd1Q03719 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnd1Q03719 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnd1Q03719 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnd1Q03719 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnd1Q03719 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcnd1Q03719 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcnd1Q03719 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcnd1Q03719 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcnd1Q03719 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnd1Q03719 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnd1Q03719 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnd1Q03719 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnd1Q03719 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnd1Q03719 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnd1Q03719 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kcnd1Q03719 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kcnd1Q03719 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kcnd1Q03719 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kcnd1Q03719 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kcnd1Q03719 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kcnd1Q03719 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms