Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brca2P97929 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brca2P97929 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brca2P97929 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brca2P97929 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brca2P97929 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brca2P97929 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brca2P97929 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brca2P97929 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brca2P97929 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brca2P97929 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brca2P97929 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brca2P97929 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brca2P97929 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Brca2P97929 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brca2P97929 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brca2P97929 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brca2P97929 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brca2P97929 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Brca2P97929 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Brca2P97929 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Brca2P97929 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brca2P97929 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brca2P97929 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brca2P97929 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brca2P97929 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brca2P97929 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brca2P97929 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brca2P97929 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brca2P97929 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brca2P97929 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Brca2P97929 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brca2P97929 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brca2P97929 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brca2P97929 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brca2P97929 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brca2P97929 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Brca2P97929 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brca2P97929 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brca2P97929 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brca2P97929 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brca2P97929 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brca2P97929 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brca2P97929 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brca2P97929 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brca2P97929 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brca2P97929 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brca2P97929 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms