Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bop1P97452 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bop1P97452 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bop1P97452 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bop1P97452 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bop1P97452 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bop1P97452 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bop1P97452 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bop1P97452 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bop1P97452 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bop1P97452 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bop1P97452 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Bop1P97452 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bop1P97452 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bop1P97452 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bop1P97452 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bop1P97452 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bop1P97452 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bop1P97452 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bop1P97452 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bop1P97452 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bop1P97452 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bop1P97452 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bop1P97452 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bop1P97452 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bop1P97452 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bop1P97452 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bop1P97452 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bop1P97452 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bop1P97452 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bop1P97452 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bop1P97452 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bop1P97452 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bop1P97452 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bop1P97452 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bop1P97452 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Bop1P97452 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bop1P97452 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bop1P97452 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bop1P97452 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bop1P97452 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bop1P97452 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bop1P97452 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bop1P97452 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bop1P97452 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Bop1P97452 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bop1P97452 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Bop1P97452 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bop1P97452 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bop1P97452 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bop1P97452 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bop1P97452 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bop1P97452 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bop1P97452 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bop1P97452 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bop1P97452 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bop1P97452 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bop1P97452 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bop1P97452 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bop1P97452 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bop1P97452 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bop1P97452 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bop1P97452 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bop1P97452 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bop1P97452 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.5 ms