Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fgf11P70378 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgf11P70378 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgf11P70378 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgf11P70378 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgf11P70378 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgf11P70378 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgf11P70378 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgf11P70378 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgf11P70378 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgf11P70378 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgf11P70378 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgf11P70378 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgf11P70378 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgf11P70378 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgf11P70378 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgf11P70378 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgf11P70378 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgf11P70378 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgf11P70378 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgf11P70378 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgf11P70378 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgf11P70378 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgf11P70378 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgf11P70378 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgf11P70378 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgf11P70378 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgf11P70378 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgf11P70378 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms