Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprvP70289 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprvP70289 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprvP70289 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprvP70289 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprvP70289 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprvP70289 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PtprvP70289 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PtprvP70289 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PtprvP70289 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PtprvP70289 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PtprvP70289 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprvP70289 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprvP70289 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprvP70289 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PtprvP70289 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PtprvP70289 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PtprvP70289 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PtprvP70289 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprvP70289 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprvP70289 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PtprvP70289 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtprvP70289 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtprvP70289 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprvP70289 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprvP70289 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprvP70289 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprvP70289 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprvP70289 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PtprvP70289 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PtprvP70289 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PtprvP70289 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprvP70289 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprvP70289 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprvP70289 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprvP70289 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprvP70289 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprvP70289 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprvP70289 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprvP70289 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PtprvP70289 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprvP70289 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprvP70289 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprvP70289 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprvP70289 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprvP70289 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprvP70289 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprvP70289 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprvP70289 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprvP70289 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprvP70289 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprvP70289 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprvP70289 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprvP70289 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprvP70289 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PtprvP70289 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PtprvP70289 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprvP70289 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprvP70289 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprvP70289 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprvP70289 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PtprvP70289 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PtprvP70289 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprvP70289 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprvP70289 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprvP70289 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprvP70289 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtprvP70289 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtprvP70289 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprvP70289 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprvP70289 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PtprvP70289 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprvP70289 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprvP70289 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprvP70289 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PtprvP70289 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprvP70289 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprvP70289 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprvP70289 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PtprvP70289 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PtprvP70289 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PtprvP70289 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PtprvP70289 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PtprvP70289 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PtprvP70289 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprvP70289 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PtprvP70289 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprvP70289 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PtprvP70289 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprvP70289 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprvP70289 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprvP70289 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprvP70289 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprvP70289 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprvP70289 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprvP70289 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PtprvP70289 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprvP70289 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprvP70289 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprvP70289 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms