Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Surf6P70279 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Surf6P70279 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Surf6P70279 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Surf6P70279 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Surf6P70279 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Surf6P70279 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Surf6P70279 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Surf6P70279 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Surf6P70279 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Surf6P70279 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Surf6P70279 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Surf6P70279 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Surf6P70279 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Surf6P70279 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Surf6P70279 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Surf6P70279 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Surf6P70279 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Surf6P70279 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Surf6P70279 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Surf6P70279 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Surf6P70279 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Surf6P70279 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Surf6P70279 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Surf6P70279 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Surf6P70279 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms