Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tuba4aP68368 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tuba4aP68368 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tuba4aP68368 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tuba4aP68368 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tuba4aP68368 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms