Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csnk2bP67871 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csnk2bP67871 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csnk2bP67871 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk2bP67871 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csnk2bP67871 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk2bP67871 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk2bP67871 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms