Protein–RNA interactions for Protein: P63147

Ube2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2bP63147 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2bP63147 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ube2bP63147 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2bP63147 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2bP63147 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2bP63147 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2bP63147 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2bP63147 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2bP63147 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms