Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps27aP62983 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps27aP62983 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps27aP62983 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps27aP62983 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms