Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl39P62892 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl39P62892 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl39P62892 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms