Protein–RNA interactions for Protein: P62743

Ap2s1, AP-2 complex subunit sigma, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap2s1P62743 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ap2s1P62743 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap2s1P62743 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap2s1P62743 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap2s1P62743 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap2s1P62743 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap2s1P62743 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap2s1P62743 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap2s1P62743 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap2s1P62743 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap2s1P62743 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ap2s1P62743 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ap2s1P62743 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms