Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbpl1P62340 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbpl1P62340 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbpl1P62340 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbpl1P62340 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbpl1P62340 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbpl1P62340 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbpl1P62340 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbpl1P62340 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbpl1P62340 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbpl1P62340 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbpl1P62340 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbpl1P62340 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbpl1P62340 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbpl1P62340 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbpl1P62340 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbpl1P62340 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tbpl1P62340 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbpl1P62340 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbpl1P62340 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbpl1P62340 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbpl1P62340 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbpl1P62340 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbpl1P62340 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbpl1P62340 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbpl1P62340 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbpl1P62340 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbpl1P62340 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbpl1P62340 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms