Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan5P62080 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan5P62080 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan5P62080 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan5P62080 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan5P62080 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan5P62080 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan5P62080 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan5P62080 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan5P62080 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan5P62080 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan5P62080 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan5P62080 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan5P62080 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan5P62080 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan5P62080 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan5P62080 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tspan5P62080 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan5P62080 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.1 ms