Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pcmtd1P59913 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcmtd1P59913 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcmtd1P59913 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcmtd1P59913 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcmtd1P59913 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcmtd1P59913 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcmtd1P59913 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcmtd1P59913 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcmtd1P59913 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcmtd1P59913 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcmtd1P59913 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcmtd1P59913 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcmtd1P59913 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcmtd1P59913 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcmtd1P59913 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pcmtd1P59913 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcmtd1P59913 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcmtd1P59913 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcmtd1P59913 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcmtd1P59913 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcmtd1P59913 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcmtd1P59913 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcmtd1P59913 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcmtd1P59913 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcmtd1P59913 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcmtd1P59913 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcmtd1P59913 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcmtd1P59913 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pcmtd1P59913 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pcmtd1P59913 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pcmtd1P59913 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms