Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Csrnp3P59055 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Csrnp3P59055 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Csrnp3P59055 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Csrnp3P59055 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Csrnp3P59055 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Csrnp3P59055 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Csrnp3P59055 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Csrnp3P59055 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Csrnp3P59055 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Csrnp3P59055 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Csrnp3P59055 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Csrnp3P59055 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Csrnp3P59055 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Csrnp3P59055 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Csrnp3P59055 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Csrnp3P59055 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Csrnp3P59055 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Csrnp3P59055 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Csrnp3P59055 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Csrnp3P59055 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Csrnp3P59055 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Csrnp3P59055 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Csrnp3P59055 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Csrnp3P59055 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Csrnp3P59055 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Csrnp3P59055 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Csrnp3P59055 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Csrnp3P59055 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Csrnp3P59055 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Csrnp3P59055 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Csrnp3P59055 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Csrnp3P59055 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Csrnp3P59055 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Csrnp3P59055 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Csrnp3P59055 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Csrnp3P59055 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Csrnp3P59055 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Csrnp3P59055 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Csrnp3P59055 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Csrnp3P59055 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Csrnp3P59055 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Csrnp3P59055 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Csrnp3P59055 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Csrnp3P59055 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Csrnp3P59055 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Csrnp3P59055 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Csrnp3P59055 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Csrnp3P59055 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Csrnp3P59055 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Csrnp3P59055 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Csrnp3P59055 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Csrnp3P59055 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Csrnp3P59055 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Csrnp3P59055 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Csrnp3P59055 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Csrnp3P59055 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Csrnp3P59055 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Csrnp3P59055 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Csrnp3P59055 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms