Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Actn4P57780 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Actn4P57780 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Actn4P57780 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Actn4P57780 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Actn4P57780 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Actn4P57780 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Actn4P57780 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Actn4P57780 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Actn4P57780 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Actn4P57780 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Actn4P57780 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Actn4P57780 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Actn4P57780 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Actn4P57780 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Actn4P57780 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Actn4P57780 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Actn4P57780 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Actn4P57780 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Actn4P57780 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Actn4P57780 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Actn4P57780 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Actn4P57780 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Actn4P57780 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Actn4P57780 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Actn4P57780 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Actn4P57780 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Actn4P57780 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Actn4P57780 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Actn4P57780 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Actn4P57780 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Actn4P57780 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Actn4P57780 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Actn4P57780 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Actn4P57780 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Actn4P57780 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Actn4P57780 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Actn4P57780 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Actn4P57780 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Actn4P57780 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Actn4P57780 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Actn4P57780 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Actn4P57780 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Actn4P57780 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Actn4P57780 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Actn4P57780 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Actn4P57780 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Actn4P57780 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Actn4P57780 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Actn4P57780 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Actn4P57780 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Actn4P57780 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Actn4P57780 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Actn4P57780 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Actn4P57780 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Actn4P57780 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Actn4P57780 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Actn4P57780 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Actn4P57780 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Actn4P57780 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Actn4P57780 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Actn4P57780 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Actn4P57780 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Actn4P57780 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Actn4P57780 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Actn4P57780 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Actn4P57780 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Actn4P57780 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Actn4P57780 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn4P57780 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn4P57780 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn4P57780 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Actn4P57780 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Actn4P57780 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Actn4P57780 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Actn4P57780 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Actn4P57780 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Actn4P57780 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Actn4P57780 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Actn4P57780 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Actn4P57780 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Actn4P57780 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Actn4P57780 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms