Protein–RNA interactions for Protein: P57016

Lad1, Ladinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lad1P57016 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lad1P57016 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lad1P57016 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lad1P57016 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lad1P57016 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lad1P57016 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lad1P57016 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lad1P57016 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lad1P57016 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lad1P57016 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lad1P57016 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lad1P57016 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lad1P57016 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lad1P57016 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lad1P57016 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lad1P57016 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lad1P57016 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lad1P57016 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lad1P57016 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.4 ms